IP實驗原理
IP又稱免疫沉淀（Immunoprecipitation），是利用抗原和抗體的特異性結合以及“proteinA/G”特異性結合到抗體的FC片段的現(xiàn)象開發(fā)出來的方法，簡單來說，抗原與抗體類似于鎖和鑰匙之間的關系，一把鑰匙（抗體）只能開一把鎖（抗原），而鑰匙可以通過鑰匙鏈（細菌蛋白的“proteinA/G”）快速找到。ProteinA/G抗體-目的蛋白復合物從混合液中沉淀下來，最后將靶蛋白從磁珠上洗脫，并通過SDS-PAGE，Western Blot等手段對洗脫下來的蛋白進行分析。
IP是用來富集目的蛋白的，那么在生物體內蛋白一般可能會與什么結合呢？
這個我想大家都知道，那就是DNA、RNA、蛋白質。通過IP的方法富集蛋白，檢測與其結合的DNA的方法即為ChIP；通過IP的方法富集蛋白，檢測與其結合的RNA的方法即為RIP；通過IP的方法富集蛋白，檢測與其結合的蛋白的方法即為coIP。
CoIP又叫免疫共沉淀，利用抗原A與蛋白質B結合，通過A的抗體（鑰匙）沉淀A（鎖），再利用精制的proteinA（鑰匙鏈）預先結合到磁珠上，使之與含有抗原的溶液及抗體反應后，磁珠上的proteinA就能吸附抗體，從而獲得抗原A與抗原B的結合體，之后就可以對B檢測，獲得蛋白質之間的相互作用信息。
RIP又叫RNA免疫沉淀，利用抗原A與RNA B結合，抗原A的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，經(jīng)過分離純化對RNA進行測序或PCR分析，就可以獲得RNA與蛋白相互作用的信息。
CHIP又叫染色質免疫共沉淀，利用抗原A與DNA B結合，抗原A的抗體把相應的DNA-蛋白復合物沉淀下來，經(jīng)過分離純化對目的DNA片段分析，就可以獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。
