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磷酸化抗體使用注意事項(xiàng)

來(lái)源:菲恩生物   發(fā)布時(shí)間:2023-08-18 14:30   點(diǎn)擊量:

蛋白質(zhì)磷酸化是一種重要的細(xì)胞信號(hào)傳遞機(jī)制,它通過(guò)將磷酸基團(tuán)添加到蛋白質(zhì)分子上,從而改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。
蛋白磷酸化和去磷酸化過(guò)程
 
蛋白激酶:將磷酸基團(tuán)加到蛋白特定氨基酸上,使蛋白磷酸化

蛋白磷酸酶:負(fù)責(zé)磷酸化蛋白的去磷酸化

磷酸化主要是針對(duì)磷酸化位點(diǎn)制備的,可以特異性識(shí)別磷酸化氨基酸位點(diǎn),檢測(cè)蛋白磷酸化水平,對(duì)磷酸化蛋白進(jìn)行定性、定量分析。磷酸化抗體可以用來(lái)檢測(cè)該蛋白在細(xì)胞受到刺激時(shí)的磷酸化水平的變化情況,側(cè)重于了解該蛋白的一種活性狀態(tài),哺乳動(dòng)物細(xì)胞中約30%的蛋白質(zhì)在一個(gè)或多個(gè)位點(diǎn)被磷酸化,不適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)磷酸化是許多人類(lèi)疾病的原因。

一個(gè)蛋白可以有多個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生磷酸化,那么有哪些氨基酸容易發(fā)生磷酸化呢?下圖展示了磷酸化類(lèi)型以及常見(jiàn)磷酸化位點(diǎn):

蛋白質(zhì)磷酸化類(lèi)型 蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)
O-磷酸化 絲氨酸(Serine;Ser;S)
蘇氨酸(Threonine;Thr;T)
酪氨酸(Tyrosine;Tyr;Y)
N-磷酸化 組氨酸(Histidine; His; H)
精氨酸(Arginine;Arg;R)
賴(lài)氨酸(Lysine; Lys: K)
S-磷酸化 天冬氨酸(Aspartic acid;Asp;D)
谷氨酸(Glutamic acid;Glu;E)
?;姿峄?/span> 半胱氨酸(Cysteine;Cys;C)

O-磷酸化類(lèi)型最常見(jiàn),在酸性條件非常穩(wěn)定,因此在細(xì)胞生物學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)中研究廣泛。N-磷酸化不穩(wěn)定導(dǎo)致其檢測(cè)具有挑戰(zhàn)性。S-磷酸化和?;姿峄难芯繄?bào)道很少。

那么如何確定一個(gè)蛋白存在哪些磷酸化位點(diǎn)呢?下面以u(píng)niprot 網(wǎng)站為例給大家介紹下查找方法:

1.通過(guò)https://www.uniprot.org/鏈接進(jìn)入uniprot 官網(wǎng),主界面如下:

uniprot 官網(wǎng)

2.以人源TAU蛋白為例,在search欄輸入TAU,進(jìn)入如下界面,找到human TAU:

uniprot 官網(wǎng)

3.點(diǎn)擊P10636進(jìn)入后,點(diǎn)擊左側(cè)PTM/Processing查看蛋白修飾情況以及修飾的氨基酸位點(diǎn):

uniprot 官網(wǎng)

磷酸化蛋白WB檢測(cè)樣本制備有哪些注意事項(xiàng)呢?

1.快、狠、準(zhǔn)。蛋白磷酸化是一個(gè)快反應(yīng),制樣過(guò)程要迅速,樣品要新鮮,全程冰上操作。所有用到的試劑,器具要提前預(yù)冷。制備的樣本需要盡快變性并放在-80°保存,避免反復(fù)凍融導(dǎo)致磷酸基團(tuán)降解。

2.裂解液中一定要加蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑,否則條帶出來(lái)會(huì)很淺。細(xì)胞裂解會(huì)釋放大量?jī)?nèi)源性蛋白磷酸酶,會(huì)催化磷酸化蛋白去磷酸化。還要注意檢測(cè)蛋白磷酸化位點(diǎn)是什么氨基酸,如果是酪氨酸位點(diǎn)磷酸化還要加1μmol/L的原釩酸鈉。

磷酸化蛋白WB檢測(cè)內(nèi)參如何選擇?

磷酸化蛋白檢測(cè)需要設(shè)置2個(gè)內(nèi)參,一個(gè)是普通內(nèi)參比如actin或GAPDH, 保證上樣量一致;另一個(gè)是磷酸化蛋白對(duì)應(yīng)的總蛋白,比如檢測(cè)AKT磷酸化,同時(shí)還要跑一個(gè)AKT總蛋白的抗體,只有磷酸化蛋白與總蛋白比值變化了才能說(shuō)明書(shū)磷酸化水平發(fā)生改變了。

WB實(shí)驗(yàn)需要提高上樣量嗎?

磷酸化蛋白表達(dá)豐度低,大概只有總蛋白10%甚至更低,所以每孔需要足夠蛋白量,必要時(shí)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行特定刺激提高磷酸化蛋白表達(dá)水平。如下圖展示,F(xiàn)Nab10910 anti- Phospho-p53 (Ser15) antibody ,UV刺激后細(xì)胞的磷酸化蛋白表達(dá)水平升高。

磷酸化蛋白檢測(cè)用什么封閉液以及一抗孵育條件?

轉(zhuǎn)膜后,建議用5%BSA封閉1小時(shí),非實(shí)驗(yàn)級(jí)別奶粉可能含有磷酸酶等雜質(zhì),不適用于磷酸化蛋白檢測(cè)。封閉時(shí)間過(guò)長(zhǎng)也會(huì)導(dǎo)致抗原標(biāo)為掩蓋。

一抗孵育建議4℃過(guò)夜,不僅讓抗體有充足時(shí)間結(jié)合,低溫環(huán)境使蛋白不容易從膜上脫落。

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